O som de Californication foi em grande parte gestado nos espaços íntimos dos músicos. As ideias começaram a tomar forma na garagem de Flea, com sessões de improvisação que deram vida às bases de baixo e percussão. Anthony Kiedis e John Frusciante passaram dias inteiros a partilhar conceitos sobre a estrutura das canções, os riffs de guitarra e as letras. Este processo colaborativo reflete-se em temas como "Scar Tissue", onde um riff comovente de Frusciante inspirou diretamente Kiedis. As letras exploram temas que vão desde as insinuações sexuais características da banda até reflexões sobre a luxúria, a morte e as lutas pessoais, como em "Porcelain", inspirada na história de uma jovem mãe a enfrentar a adição.
O álbum ressoou fortemente tanto na crítica como no público, revitalizando a carreira da banda. Canções como "Around the World", "Otherside", "Californication" e a vencedora de um prémio Grammy, "Scar Tissue", tornaram-se pilares do seu repertório. A crítica destacou a mudança para um som mais introspectivo e espiritual, afastando-se do puramente energético. Foi assinalado que a voz de Anthony Kiedis tinha ganho um alcance e uma expressividade notáveis, e muitos atribuíram o renascimento do som dos Red Hot Chili Peppers ao regresso de John Frusciante, considerado por alguns como o guitarrista ideal para a banda.