Le successive sessioni di registrazione, che si estesero da maggio a ottobre 1968 negli EMI Studios, furono segnate da una crescente tensione interna. Differenze creative e discussioni divennero frequenti tra i membri della band. Questo clima di conflitto si intensificò con la presenza di Yoko Ono alle sessioni, cosa che metteva a disagio la maggior parte, ad eccezione di John Lennon. Nel mezzo di queste dispute, l'ingegnere Geoff Emerick lasciò la band e il batterista Ringo Starr si dimise addirittura temporaneamente in agosto, con Paul McCartney che assunse la percussione su alcune tracce. Nonostante queste frizioni, l'album doppio, che includeva brani come Back in the U.S.S.R. e Dear Prudence, riuscì a raggiungere il primo posto nelle classifiche sia nel Regno Unito che negli Stati Uniti.
L'uscita dell'album nel novembre 1968 ricevette recensioni contrastanti. Mentre alcuni critici sottolinearono l'apparente mancanza di coesione e la natura satirica di alcune canzoni in un contesto sociale e politico turbolento, altri lodarono la qualità della scrittura di Lennon e McCartney. Col tempo, l'album è stato riconosciuto per la sua diversità stilistica, spaziando dal music hall e folk all'art rock, blues, hard rock e sperimentazione sonora. Nel 2003, la rivista Rolling Stone lo ha classificato al decimo posto nella sua lista dei 500 migliori album di tutti i tempi. Un remix ampliato dell'album, a cura di Giles Martin, è stato pubblicato nel 2018.
